Потому, что так удобнее.
Аэродинамические коэффициенты, вообще-то, можно отнести к чему угодно (в дирижаблях, например, их относят к объему в степени 2/3): принятые методики дают возможность построить поляру крыла без фюзеляжа и оперения; продуть такое крыло, проверив сходимость результатов продувки и расчета; произвести продувку отдельных агрегатов и самолета в сборе, получив уже поляру всего самолета - и получить картину взаимовлияние всех агрегатов.
Продувая отдельно, скажем, две консоли с пустотой на месте фюзеляжа получили бы кардинально отличающуюся картину распределения циркуляции, а так - вполне вменяемые поправки в виде просадки циркуляции на участке крыла, занятого фюзеляжем.